此次全国土地清查由监察部、国土资源部等部门牵头组织，官方称为“土地执法专项行动”。与以往不同的是，此次全国土地清查，国土资源部直接将矛头指向了城市和省政府。
“（执法行动）本月将在全国范围内展开。”国土资源部执法监察局局长张新宝告诉记者。
张新宝指出，这次土地执法专项行动中最能切中要害的就是严格实行“问责制”：这场全国性的土地违法清查问责对象，从直指城市政府部门的一把手，延伸到了省部级官员。
张新宝表示，这次土地清查的具体做法是，地方先进行自查，然后上报自查情况，再由上级部门进行检查，以达到“自查自纠、查处案件”的目的。
10月12日，来自北京市纪委执法监察室的消息证实了张新宝的说法。据悉，北京市监察局、国土局正在对北京土地违法违规问题进行清理，要求严肃查处一批重大典型案件，对非法批地和暗中支持、纵容、默认导致土地被违法占用的国家机关工作人员，特别是领导干部，要依法追究党政纪责任。
今年4月份以来，针对土地违法行为有所抬头的现象，根据国务院领导批示精神，国土资源部采取了一系列措施，加大执法力度，坚决依法严肃查处土地违法行为。
4月15日，公开调查安徽、河北两起案件；5月29日，与监察部一道公开调查5起案件，并责令陕西省查处一起案件；5月30日，下发《关于进一步从严土地管理的紧急通知》，要求严肃查处土地违法违规行为；6月1日，召开全国土地执法紧急会议，对各省查案进行明确部署；6月14日，又下发了《关于严明法纪坚决制止土地违法的紧急通知》。8月31日《国务院关于加强土地调控有关问题的通知》要求，对本行政区域内发生土地违法违规案件造成严重后果的，对土地违法违规行为不制止、不组织查处的，今后都要追究有关地方政府负责人的领导责任。
9月27日，国务院严肃查处郑州非法批准征占土地案，是国土资源部与监察部公开调查的5起案件之一。记者获悉，另外7起公开调查和责令查处的土地违法、违规案件，已经全部调查完毕，监察部和国土资源部已经提出了处理意见并下发至地方，目前相关地方正在办理落实中。
“本次全国范围内的土地违法专项调查，是在查处非法批地、未批先用、批少用多、非法低价出让国有土地使用权等行为的同时，意在严肃惩处土地违法违规行为，遏制土地违法违规行为大量发生的势头，以达到促进国家宏观调控措施的落实。”张新宝说。